Franchement j'en ai aucunes idées car je n'ai pas utilisé cette option là uniquement le xbrowser.
Mais à mon avis le log va cloner ton dur de facon identique donc tu te retrouveras avec deux durs ayant la meme arborescence...
Par contre essaies de formater au format FATx ton viereg avant le clonage sans quoi je pense qu'il ne tournera pas dans la box.
Sur ce coup là je ne peux pas trop m'avancer car je n'ai pas été confronté à ce prob.
Enfin l'essentiel c'est d'avoir un Dur lockable tu peux toujours l'utilisé en attendant.
Sinon vu que tu as l'eeprom tu ne risques rien...donc fais des essis tentes une premiere copie à la volée pius essaie le dans la console on verra.