Prendre un CD de recuperation genre Gentoo minimal ou SystemRecueCD.
Monter tes partitions linux quelque part (genre /mnt/gentoo et /mnt/gentoo/boot si tu as pas de LVM et que tu utilises le CD que je t'ai dit)
faire un chroot pour revenir a ton systeme comme tu le connais avec tes programmes. "chroot /mnt/gentoo /bin/bash" dans l'exemple.
Et reconfigurer grub ou lilo comme il le conviens en fonction de ta config ... grub.conf ... lilo.conf toussaaa
Je sais c'est pas tres explicite mais en gros c'est la manip
EDIT : Sinon essayer de rattraper linux via le bootloader Vista et EsayBCD ... mais je suis pas sur du tout.
Sinon oui tu aurais grandement du l'ecouter ... car seul linux est "aware" du fait qu'il doit laisser les OS windows dans sa config de boot ...