C'est quoi la différence entre tes deux partitions ? L'une est lecteur logique, l'autre est une partition principale ?
Truc con à essayer: Changer la lettre de la partition. D devient E et E devient D. Retester. Si les autorisations sont justes, je vois pas pourquoi ça marcherait pas.
Surtout que "Typsoft" ne mentionne aucune limite du nombre de partitions accessibles...
T'as le même problème sous "FileZilla Server" ?