t'as pas mal de soucis apparement
Bon, le mieux je pense serait de remettre tout ça proprement avec un backuo de tes partitions à problème sur un PC et un format de ces dernières. Mais je crois savoir qu'il s'agit là de partitions assez volumineuses(films....), je me trompe?
Pour la perte de place, si aucun fichier n'apparait et que nul autre fichier de l'arborescence pourrait se cacher derrière ce transfert raté, je miserai sur une mauvaise allocation/desallocation.
En somme la FAT de ta partition pourrait être corrompue, mais ça me parraitrait qd meme gros vu que c'est le kernel qui s'occupe de ça.
Es-tu absolument certain qu'aucun fichier résiduel ne traine quelque part dans l'arborescence?
Mais bon je pense qd meme qu'un backup, et un format restent la solution la plus fiable.