[SOLDIER_no_Sephiroth]

Ca peut venir comme dis Kira du VBR si c'est du MP3, une solution pourrait être d'essayer en OGG vorbis ou AAC dans un conteneur MKV.
Sinon, le fait de faire d'autres tâches en même temps que l'encodage ne devrait pas provoquer ce genre de problème, enfin c'est peu probable, comme dit plus haut, ça le ralentit, voir même planter l'application qui s'occupe de l'encodage si les autres applications charge trop.