"Pour mettre à jour Launchelf, il suffit de remplacer le fichier boot.elf dans le dossier bedata-system ?"

Oui, mais attention à la manière dont tu le lances: je ne sais pas si le fichier LaunchElf peut se remplacer lui-même. Il faut peut-être le lancer d'ailleurs: lancer un 2e launchElf avec le premier, et remplacer le premier.