Ca marche avec la commande shutdown mais le problème c'est que le pc ne s'eteint pas vraiment tout seul...
En effet, après la fermeture de windows un beau message vous indique : "vous pouvez éteindre votre ordinateur" (sous xp pro en tout cas).
Et c'est bien le problème, on n'a pas envie de s'em*****r à appuyez sur le bouton...
Encore une fois je conseillerais l'usage du log X'nstop, hyper simple d'utilisation

¤Scar¤ ---> Vas faire un tour dans ton bios, parfois ya un menu qui permet justement de meetre hors tension les disques durs après un temps d'inactivité...