Le RTS de la DSTwo possède 4 slot. Une détection automatique des jeux 3D pour augmenter la stabilité du RTS sur ces jeux a été rajoutée. La vitesse pour le RTS en écriture ou en lecture est de deux secondes. L'interface est bien plus belle grace au possibilité du nouveau PCB (hardware).
Les sauvegardes RTS peuvent être renommées (exclusivité mondiale). Le joueur peu modifier le nom de chaque slot de RTS à fin de mieux reconnaitre les sauvegardes. Les informations de sauvegarde, date et heure de la dernière modification, sont affichées.