Si tu veux installer MoonShell sur ta carte microSD, suit la procédure que j'ai écrite sur une des pages précédentes. A savoir que c'est le Setup de MoonShell qui copie automatiquement le répertoire moonshl et le fichier .nds correspondant.
Tu peux procéder à la défragmentation à tout moment sans risque de perte de fichier à priori, mais la défragmentation sur un carte microSD de quelques Go, je ne vois pas bien ce que ça pourrait changer, surtout avec l'outil de Windows...
Logiquement, tu devrais lancer une défragmentation une fois que tous les fichiers sont en place sur ta carte afin d'obtenir les meilleur performance.
Par rapport à un éventuel lague à la lecture des vidéos, je pense qu'il s'agit plutôt d'un mauvais réglage des options de DPGTool.
Si ça peut t'aider, voici mes paramètres :
