Effectivement si la pile a bougé... ça peut avoir touché autre chose
mais ça m'étonnerait beaucoup!

En revanche les pattes de la pile, elles, elles pourraient très bien avoir touché quelque chose...

Moi je dirais de revenir à un firmware plus ancien et en mode GBA

Vider complètement la mémoire flash et ne laisser que le firmware dessus!